在世纪之交，地球上的怪物已经被安全地围捕并在怪物之地进行研究。当一个被称为 的外星人种族在世界各地释放怪物时，混乱爆发了。

零式战斗机的赞歌……

哥斯拉的儿子米尼拉第一次出现在南海的佐格尔岛上，与怪物卡玛库拉斯和库蒙加对峙。从这部作品中，特效导演受到了大师圆谷英二对他的弟子有岛贞正的接力棒。哥斯拉和米尼拉的父母和孩子的爱情被清晰地描绘出来。

地球联合宇宙局发现外太空有个 星球，因为 星球发射电波而发现，宇宙局派出太空船 1前去探查，太空人富士和古连到 星球时却备受礼遇，而 星球的人表示为了消灭在当地作乱的王者基多拉，需要借出哥吉拉和拉顿。

不明妖星哥拉斯在茫茫宇宙中不断前进，沿途吸附大量的星际飞行物，不断的变庞大，日本的观测宇宙船隼号，为了探明其质量大小，不幸被一起吸附，但是其在最后关头向地球发出了其质量数据，使地球上的人对其有了个初步

摄影师工藤太郎在坐飞机的途中发现一架太空囊坠入大海，那正是4个月前离奇失踪的无人木星探测器赫利俄斯7号。回国后的工藤接到陪同开发公司调查队前往塞吉欧岛的工作，而塞吉欧岛正位于赫利俄斯7号坠落地点的附近

　两个浪人——个以前是武士，一个以前是农民——陷入了一场复杂的地方官员的谋杀和背叛的游戏......